Хотя к кишечнику долгое время относились без должного внимания, считая его просто пищеварительной трубкой, в последнее время медицинские исследования заново открыли для себя этот орган. Из самой глубины нашего организма «кишечный мозг» влияет как на наши чувства, так и на наше мышление. Связь между метаболизмом микробиома (кишечной флоры) и психикой — это, без сомнения, одна из самых увлекательных тем в микробиологических исследованиях. В последние годы растёт число указаний на то, что психические заболевания сопровождаются изменениями кишечной флоры —, это подтверждает и исследование пациентов с депрессией, опубликованное в журнале Nature Microbiology Journal.

Связь между метаболизмом присущей организму кишечной флоры и психическим здоровьем — это одна из самых увлекательных и одновременно наиболее противоречивых и дискуссионных тем в исследованиях микробиома. Хотя на настоящий момент исследована лишь малая доля живущих в кишечнике микроорганизмов, мы уже точно знаем о тесном взаимодействии микробиома, кишечника и мозга. Кишечные бактерии не только в известной степени влияют на мир наших чувств и мыслей, но и, предположительно, на некоторые болезни (от депрессий до аутизма), возможно связанные с изменением состава микробиома. При этом, однако, пока непонятно, что было раньше: яйцо или курица. То есть: изменяется ли сперва состав кишечной флоры, что вызывает болезнь, либо болезнь влияет на микрофлору, изменяя её состав. В то время как связь между кишечной флорой, кишечником и мозгом уже исследована в нескольких моделях на животных, специальные исследования на людях ещё ждут своих авторов.